An der Johann-Peter-Hebel-Schule gibt es jahrgangshomogene und jahrgangsübergreifende Klassen.
In den jahrgangshomogenen Klassen arbeiten Kinder eines Jahrgangs zusammen. Die Kinder bleiben von der ersten bis zur vierten Klasse als Gruppe zusammen. In der Regel werden die Kinder während der gesamten Grundschulzeit von einer Klassenlehrkraft begleitet. In den Jahrgangsklassen werden neben gebundenen auch freie Arbeitsphasen angeboten, in denen das individuelle und selbständige Arbeiten gefördert wird.